Escudo de la República de Colombia Escudo de la República de Colombia

Integrantes

Profesores líderes

Clara Isabel Bermúdez Santana

Departamento de Biología. Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.

Intereses: Estudio y modelación del transcriptoma. Organización genómica de RNAs no codificantes y Modelación de estructura de ácidos nucléicos

http://www.docentes.unal.edu.co/cibermudezs/
http://www.bioinf.uni-leipzig.de/~clara/

Contacto: cibermudezs@unal.edu.co

Gustavo Rubiano

Departamento de Matemáticas. Universidad Nacional de Colombia         

Intereses: Topología y estudio de Fráctales

http://www.docentes.unal.edu.co/gnrubianoo/

Estudiantes de doctorado

Jenny Consuelo Ortega Rojas

Bióloga, Magister en Neurociencias, Estudiante de Doctorado Ciencias-Biología-Universidad Nacional de Colombia

Contacto: biojenny08@gmail.com

Proyectos en curso: La Enfermedad de Alzheimer esporádica ha sido objeto de investigación debido a su alta prevalencia e incidencia. El enfoque de la investigación realizada en colaboración con el Grupo de Neurociencias de la Universidad Nacional de Colombia es la búsqueda de factores genéticos y epigenéticos de riesgo para la enfermedad en pacientes Colombianos. Como proyecto de Doctorado se propone el secuenciamiento de genomas completos con el fin de encontrar variaciones genómicas que podrían estar involucradas en el desarrollo y progresión de la enfermedad en Colombia.

Joseph Alape Ariza

Estudiante de  Doctorado en Biología- Universidad Nacional de Colombia

Contacto: jalapea@unal.edu.co

Proyectos en curso: La muerte súbita es una enfermedad ocasionada generalmente por la pérdida del pulso cardiaco repentino debido a una arritmia y es considerado como un importante problema de salud pública a nivel mundial. En Colombia, no se existen estudios poblacionales de marcadores moleculares asociados al fallecimiento por muerte súbita, lo cual ha conllevado a que dichos fallecimientos sean abordados exclusivamente por los estudios de patología, y que no se tenga información, dada las características de trabajar post-mortem, fácilmente aplicable, para el diagnóstico y la prevención. En el presente estudio, se pretende analizar marcadores moleculares tipo SNPs de microRNAs asociados a muerte súbita cardiaca en corazón estructuralmente sano, con el fin de establecer posibles marcadores moleculares como una herramienta adicional a los estudios de patología forense.

Estudiantes de maestría

Camilo Alejandro Cerón Noriega

Biólogo, Candidato a MSc en Bioinformática-Universidad Nacional de Colombia.

Contacto: caceronn@unal.edu.co

Intereses: Evolución del sistema inmune, Inmunogenetica, Primates Neotropicales

Proyectos en curso: El objetivo de mi trabajo de maestría es plantear posibles genes candidatos al sistema inmune en el tunicado Didemnum vexillum, teniendo como primer paso la reconstrucción del genoma de dicho protocordado por medio de herramientas computacionales; de esta reconstrucción se espera poder inferir regiones de sintenia compartida con otras especies de tunicados, generando así un panorama general de la evolución del sistema en estos cordados basales, dilucidando algunas de las bases evolutivas de la complejidad observada en los vertebrados superiores.

Diego Alfonso Melo-Escobar

Candidato a MSc en Ciencias -Biología-Universidad Nacional de Colombia

Contacto: diameloes@unal.edu.co

Proyectos en curso: Identificación de regiones conservadas y estructuradas de tRNAs candidatas a procesar RNAs pequeños en primates Catarrhini. El objetivo de este estudio es identificar RNAs pequeños procesados específicamente, derivados de secuencias estructuradas de tRNAs en cinco especies del clado catarrhino en primates.  Se explorarán los genomas de Macaca mulata (Cercopithecidae), Pongo pygmaeus, Pan troglodytes, Homo sapiens y Gorilla gorilla (Hominidae) con aproximaciones computacionales, con el fin de identificar los posibles loci de los genes tRNA de estas especies.

Oscar J. Escobar-Soto

Biólogo, Candidato a Maestría en Neurociencias- Universidad Nacional de Colombia.

Contacto: ojescobars@unal.edu.co; ojescobars@gmail.com

Intereses: Neurofisiología celular, Mecanismos de regulación post-transcripcional mediada por ncRNAs, evolución de RNAs, estúdios de interacción de dupletas de RNA-RNA.

Proyectos en curso: En la actualidad estoy trabajando en el estúdio de interacciones entre de mRNA-ncRNA y sus implicaciones en la regulación post-transcripcional de genes relevantes en la Enfermedad de Alzheimer.

Aimer Alonso Gutierrez Diaz

Biólogo de la Universidad Nacional de Colombia.

Candidato a Maestría en Bioinformática en la Universidad Nacional de Colombia.

Contacto: aiagutierrezdi@unal.edu.co

Intereses: Evolución de  RNA virus  y ncRNAs en especial  miRNAs. Transcriptomica, en particuar "Pervasive transcription" y Estadística genómica 

Proyectos en curso: Mi tesis de maestría se titula "Detección automatizada de pequeños fragmentos derivados de RNAs no-codificantes expresados diferencialmente frente a la infección del virus Dengue", mi principal interés es describir por primera vez el fenómeno de fragmentación funcional ante la infección del virus Dengue en humanos. Este fenómeno consiste en que moléculas de tipo RNA no codificante del huésped, como los tRNAs y snoRNAs, pueden en ciertas circunstancias, a través de un procesamiento post-transcripcional, funcionar como fuentes de pequeños fragmentos con características similares a miRNAs, los cuales se han visto asociados con promover o favorecer la replicación de virus como el virus de la hepatitis C, B, el virus sincitial respiratorio entre otros 

Edgar Torres

Matemático, estudiante de maestría en ciencias-Matemática aplicadas- Universidad Nacional de Colombia

Intereses: Modelación matemática y estudios del Transcriptoma utilizando propiedades de la combinatoria.

Leidy Tatiana Garcia Navarrete

Candidato a Maestría en Bioinformática en la Universidad Nacional de Colombia.

Contacto: ltgarcian@unal.edu.co

Intereses: Genómica comparativa y evolutiva de especies vegetales con interés agronómico. Ensamblaje Genómico.   

Proyectos en curso:Actualmente me encuentro trabajando en generar una estrategia computacional para detección y caracterización de bloques microsintenicos relacionados a regiones genómicas asociadas a domesticación en frijol Lima, este proyecto se realiza en colaboración con el grupo de Horticultura, de la Facultad de Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional de Colombia.

Lus Stefany Botero

Maestria en Bioinformática

Genomica viral comparativa del virus Dengue

Estudiantes de pregrado

Laura Milena Nova Arias

Estudiante de Biología- Universidad Nacional de Colombia

Contacto: lmnovaa@unal.edu.co

Interéses: dominios proteicos del sistema inmune, genomica comparativa, evolución. 

Proyectos en curso: Actualmente trabajo en la búsqueda de genes que codifican para proteínas con dominios NB en yuca Manihot esculenta en base al genoma de referencia, y se pretende hacer una comparación con variedades como KU50 y W14

Gabriel Luis Hernandez Gomez

Estudiante de Biología- Universidad Nacional de Colombia

Contacto: glhernandezg@unal.edu.co

Intereses: evolución, cordados, sistema inmune, sistemática filogenética.

Actualmente trabajamos en la evolución del sistema inmune en los cordados. Nos enfocamos en identificar dominios del sistema inmune adaptativo en tunicados coloniales y pelágicos. En el futuro nos gustaría analizar datos de expresión diferencial para corroborar nuestras hipótesis.

Valeria Cadena

Pregrado en Biología

Estudio evolutivo de genes del aloreconocimiento en tunicados